kembizt-molalap.htm

gén, mutációk és hatásaik

genotípus – fenotípus

a fenotípus kialakításáért a fehérjék felelősek

(F. Engels [1865!]: “az élet a fehérjetestek létezési módja”)

GENOTÍPUS – FENOTÍPUS

minden tulajdonság, ami megjelenhet az élet során

-

ami ténylegesen megjelenik egy élőlényben

Genom – fogalom, genetikai és fizikai definíció

Humán genom:

mindazon információk összessége, amely

az "ember" felépítéséhez szükséges

sejtmagban található DNS tárolja (+mtDNS)

A humán DNS szerveződése

(méret, kódoló szekvencia arány, “kiterjesztett” gén fogalom)

humán genom – „fizikai” és „genetikai” definíció

mérete 3 x 10⁹ bp (2003-03-26: 2.825.476.206 bp)

kb. 120 cm (!) összes DNS hossz sejtenként

50.000 - 100.000 ~30.000 gént tartalmaz

(gének, +pszeudogének, +gén-szerkezetű szekvenciák)

ez 24-féle kromoszómán tárolódik

(22 autoszóma, X és Y szex-kromoszóma)

minden kromoszóma egy-egy szál DNS

A DNS

kb. 10%-a tartalmaz fehérje szintézishez felhasznált

kódot (b.é. regulátor szekvenciák)

kb. 3%-a expresszálódik (exon)

A géneken belül (intron) és a gének között 90-95%

át nem írt szekvencia

rajta (fajspecifikusan) meghatározott sorrendben helyezkednek el a gének

A DNS szerveződése:

kromoszómák, egy-egy DNS szál, mindegyiken rengeteg gén

Az információ szerveződése:

bázisok, "tripletek", "genetikai kód"

Virális kód: csak fontos információ, "szünetmentes"

a teljes DNS-ben tárolt információ "hasznos", átfedéses (!)

Prokarióta kód: szünetmentes, átfedés mentes

Eukarióta kód: NEM szünetmentes - "átfedés mentes" - ??

(azonos kód használat promóter-használat függvényében, splicing variabilitás…)

A genom megismerése: HGP

citogenetikai térképek: felbontás ~ 1 cM (centiMorgan) ~= 1 Mbp

linkage térképek: felbontás ~ 1 cM (centiMorgan) ~= 1 Mbp

“klóntérképek”: felbontás ~1 – 1.000 kbp

fizikai térképek: felbontás 1 bp

leíró „genomika” az 1980-as évektől

funkcionális „genomika” ~1995-től

„proteomika” („a jövő”) ~2000-től

polimorfizmusok, repetitív szekvenciák, módosított szakaszok

parentális allélek

- nukleotid szintű eltérések (SNP > 6.107.661* ismert! dbSNP)

*humán, „submitted”, 2003-03-26

humán, „reference”: 3.736.344

populációs eltérések

Mutáció – polimorfizmus ?

polimorfizmus előfordulási arány: >1%, mutáció: <1%

SNP – eddigi ismeretek alapján:

átlagos „sűrűség”: 10,601 SNP per 10 kbp

- 943 bázisonként 1 SNP

- repetitív szekvenciák eltérései

mikroszatellitek (1 -6nt)

di- trinukleotid repeats

VNTR

mobilis elemek (retrotranszpozonok)

LINE - 6 kbp 5'-UTR, ORF1&2, RT, 3'pA

repetitív szekvenciacsaládok

alu

mutációk

pontmutációk: egyetlen bázist érintenek

deléciók, inzerciók: sok bázist, néha génszakaszokat vagy géneket érintenek

kromoszóma mutációk: kromoszóma-szakaszokat, teljes géneket

érintenek

környezeti mutagén tényezők